(1)胚胎发育不全：孕卵异常是早期流产的主要原因，在妊娠头两个月的流产中，约有80%是由于精子和卵子有某种缺陷，以致使胚胎发育到一定程度而终止，因此，这种流产的排出物中，见不到原始的胚胎组织。
(2)内分泌功能失调：受精卵在孕激素作用下，才能在子宫壁上着床，生长发育成胎儿。当体内孕激素分泌不足时，使子宫蜕膜发育不良，从而影响受精卵的发育，容易引起流产。如果前列腺素增多，会引起子宫肌肉的频繁收缩，也会导致流产。甲状腺功能降低，可使细胞氧化能力障碍，进而影响胚胎的生长发育而流产。
(3)生殖器官疾病：子宫畸形如双角子宫、纵隔子宫、子宫发育不良。盆腔肿瘤，尤其是粘膜下肌瘤等均可影响胎儿的生长发育而导致流产。子宫内口松驰或宫颈深度裂伤都引起胎膜早破而发生晚期流产。
(4)孕妇全身性疾病：孕妇患有流感、伤寒、肺炎等急性传染病，细菌毒素或病毒通过胎盘进入胎儿体内，使胎儿中毒死亡。高热可促进子宫收缩而引起流产。孕妇患有重度贫血、心力衰竭、慢性肾炎和高血压等慢性病，可因胎盘梗塞及子宫内缺氧而使胎儿残废，而致流产。孕妇营养不良，特别是维生素缺乏，以及汞、铅、酒精中毒均可引起流产。
(5)外伤：孕妇的腹部受到外力的撞击、挤压，以及孕妇跌倒或参加重体力劳动、剧烈体育运动；腹部手术如阑尾炎，或卵巢囊肿手术均可引起子宫收缩而发生流产。
(6)情绪急骤变化：孕妇的情绪受到重大刺激，过度悲伤，惊吓，恐惧，及及情绪过分激动，可引起孕妇体内环境失调，促使子宫收缩引起流产。
(7)胎盘发育不良：胎儿在母体内生长发育，主要通过胎盘将母体的营养物质和氧输送到胎儿，如果胎盘发育不良或出现疾病，胎儿得不到营养物质和氧而停止生长引起流产。
(8)母儿血型不合：孕妇过去曾接受过输血，或在妊娠过程中产生和血型不合的致凝因子，会使胎儿的体内细细胞发生凝集和溶血，从而引起流产。
二、首先了解流产原因，强调夫妇同时诊断，不仅查女方，应重视男性因素，有条件的医院均已设立遗传优生咨询门诊。习惯性流产的诊治为其重要内容之一。
(一)详细询问既往妊娠史、既往病史、家族遗传史，有可疑遗传病史应绘制家谱图。
(二)进行全身系统检查及妇科检查。
(三)进行必要的化验及辅助检查。男方：精液常规、血型、染色体等。女方：阴道细胞涂片、宫颈评分、基础体温、血型、染色体、B超检查子宫发育情况有无畸形等。
(四)可根据情况进一步检查：
1.疑子宫畸形除B超外，可行子宫输卵管造影、子宫镜、腹腔镜检查。
2.疑内分泌异常，检查空腹血糖。可结合基础体温行子宫内膜病理检查及放免查孕酮、LH、FSH、PRL、E2、T3、T4、TSH、17-OH、17-Cu等检查，必要时可行颅脑CT，了解脑下垂体有无微腺瘤等。
3.疑特殊感染可查巨细胞病毒，弓形体、衣原体检查。
4.有不良环境接触史者，行SLE、微核、染色体畸变率检查。
5.疑ABO血型不合者，进一步检查抗体效价。如妊娠期进行间段检查，抗体效价是否有改变。接受治疗后效价是否下降。
习惯性流产是自然流产中的一种类型。自然流产连续发生3次及3次以上，即可诊断为习惯性流产。
引起自然流产的原因主要有：
1.遗传因素，由于染色体的数目或结构异常所致的胚胎发育不良，是流产最常见的原因，在占全部妊娠15%~20%的自然流产中，遗传因素可占60%~70%。，(流产儿染色体异常占50%~60%，夫妇一方或双方有染色体异常的约占10%)。由此可见，遗传因素是自然流产的最主要的元凶，尤其是怀孕头3个月内的流产。
2.外界不良因素的影响，大量吸烟(包括被动吸烟)、饮酒、接触化学性毒物、严重的噪音和震动、情绪异常激动、高温环境等一切可导致胎盘和胎儿损伤的因素都可造成流产。
3.母体疾病，母体患任何不利胎儿生长发育的疾病都可造成流产。
4.父方因素，有关研究显示，大约有10%~15%的男性精液中含有一定数量的细菌，可影响孕妇使胚胎流产，近来发现有一种无症状的菌精症可导致孕妇流产。
自然流产是孕妇的不幸，但从某种意义上讲，自然流产正是人类不断优化自身的一种方式，也正是对孕育着的新生命进行选择，优胜劣汰是大自然的法则，占流产50%以上的染色体异常，胎儿早期流产会减少畸形儿的出生，因此，在保胎前应尽可能的查明原因，尤其是习惯性流产，不要盲目保胎。
怎样减少流产的发生？发生习惯性流产，夫妇双方应做全面的体格检查，特别是遗传学检查，基因学的发展将会给患有习惯性流产的夫妇带来福音。找出造成习惯性流产的原因，根据原因加以防止和治疗才能有效的控制其发生：
1.发生流产后半年以内要避孕，待半年以后再次怀孕，可减少流产的发生。
2.要做遗传学检查，夫妇双方同时接受染色体的检查。
3.做血型鉴定包括Rh血型系统。
4.有子宫内口松弛的可做内口缝扎术。
5.针对黄体功能不全治疗的药物使用时间要超过上次流产的妊娠期限(如上次是在孕3月流产，则治疗时间不能短于妊娠3月)。
6.有甲状腺功能低下，要保持甲状腺功能正常后再怀孕，孕期也要服用抗甲低的药物。
7.注意休息，避免房事(尤其是在上次流产的妊娠期内)，情绪稳定，生活规律有节。
8.男方要做生殖系统的检查。有菌精症的要治疗彻底后再使妻子受孕。
9.避免接触有毒物质和放射性物质的照射。
